TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering

New #PhD offer: Modelling membrane filtration operations used in wastewater reuse and drinking water production: towards a generic and systemic approach 🖊 Contacts: Christelle GUIGUI and Antonin AZAÏS ➕ https://lnkd.in/e3EfmYnJ

[Scientific Report Publication] Un récente étude vient de sortir dans la revue Scientific Reports intitulée : "Geometry-encoded molecular dynamics enables deep learning insights into P450 regiospecificity control" Bravo à l'équipe Denis Pompon, Garcia-Alles Luis F. & philippe urban ➕ A lire : https://lnkd.in/emaCGkAv 📃 Résumé : Cytochrome P450 1A2, as many P450 isoenzymes, can generate multiple metabolites from a single substrate. A loose coupling between substrate binding and oxygen activation makes possible substrate reorientations at the active site prior to catalysis. In the present work, caffeine oxidation to alternative bioactive compounds was used to decipher this pluripotency. A model involving two interacting subsites capable of sequentially accommodating one or two caffeine molecules was considered. Molecular dynamics was used to characterize subsite interactions and feed a dedicated geometric encoding of trajectories that was coupled to dimensional reductions and differential machine learning. The two subsites differentially control caffeine orientations and can exchange substrate through a phenylalanine gated mechanism. This exchange can be locked by the presence of a second bound molecule. Complementary roles of subsites in progressively determining the caffeine orientation during its approach to active oxygen were examined. Interestingly, substrate face flipping becomes impaired upon entry into the rather flat active site. This makes the mechanisms that define the orientation of caffeine relative to active oxygen dependent on the substrate face oriented toward heme. Globally, this evidenced that P450 1A2 regioselectivity results from local determinants combined with subsite interactions and caffeine face preselection at a longer distance.

A three-year Post-doctoral position in biochemical engineering available at CNRS@CREATE, Singapore in collaboration with TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering https://lnkd.in/e3EfmYnJ

A three-year Bioprocess Engineer position available at CNRS@CREATE , Singapore in collaboration with TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering ➕ https://lnkd.in/e3EfmYnJ #Job

We are hiring 📢 #Postdoctoral Position in Computational Protein Design and Molecular Modelling 🖊 (Biocomputing/Structural Bioinformatics) The postdoctoral researcher at TBI will play a key role in an interdisciplinary project. 📃 2 year fixed-term contract 👩🔬 Contacts: Sophie Barbe and Thomas Schiex ➕ https://lnkd.in/e3EfmYnJ

[COMMUNIQUÉ DE PRESSE] Avancée majeure en biologie : une IA générative hybride conçoit de nouvelles molécules ! 🔬 Prédire la structure des protéines, en créer de nouvelles. ✨ Le design des protéines est un domaine de recherche en pleine révolution grâce aux possibilités offertes par l’IA, avec en ligne de mire la conception de nouvelles protéines et enzymes avec des applications directes en santé et en environnement. Cette IA hybride est ainsi capable de concevoir des protéines selon des règles apprises par apprentissage profond, mais aussi issues de la physique ou explicitées par les designers. Des résultats qui contribuent au panorama des méthodes de design de protéines présentées dans la revue Nature Magazine Reviews Methods Primers. 👏 Un travail réalisé par Sophie Barbe ( TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering, INRAE, INSA Toulouse - Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse) et Thomas Schiex (UR MIA, Toulouse) ➕ https://lnkd.in/enW45uZ7 INRAE Occitanie-Toulouse INRAE Département TRANSFORM

[Nature Sustainability Publication] - Fabriquer de la nourriture à partir de nos déchets organiques : une fausse bonne idée ? 💡🤔 Les technologies « waste-to-nutrition » visent à transformer les déchets d’origine agricole ou alimentaire en ingrédients pour l’alimentation humaine et animale, tout en réduisant l’impact environnemental des systèmes alimentaires. Une équipe du laboratoire ont évalué l’impact environnemental de 5 de ces technologies dans 9 scénarios d’utilisation en France. Ils les ont comparés aux technologies de valorisation des déchets déjà existantes comme la méthanisation ou le compostage. Leurs résultats, publiés dans Nature Magazine Sustainability, montrent que ces nouvelles technologies n’ont pas systématiquement de bénéfices environnementaux par rapport aux solutions existantes. Bravo à Ugo Javourez Ligia Barna Massimo Pizzol et Lorie Hamelin pour cet excellent résultat ! ➕ https://lnkd.in/daHjda-Z --- [Nature Sustainability Publication] - Making food from our organic waste: a good idea only at first sight?💡🤔  “Waste-to-nutrition" technologies aim to transform agricultural or food waste into ingredients for human and animal consumption, while reducing the environmental impact of food systems. INRAE scientists assessed the environmental impact of 5 of these technologies in nine usage scenarios in France. They compared them with existing waste recovery technologies such as anaerobic digestion and composting. Their results, published in Nature Sustainability, show that these new technologies do not systematically provide any environmental benefits compared with existing solutions. Well done to Ugo Javourez, Ligia Barna, Massimo Pizzol and Lorie Hamelin for this excellent result! ➕ https://lnkd.in/daHjda-Z INRAE Occitanie-Toulouse INRAE Département TRANSFORM INSA Toulouse - Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse

Rencontre avec David Camilo Corrales notre ingénieur de recherche INRAE Occitanie-Toulouse spécialiste de l'IA !

Hier se sont tenues les Olympiades Académiques de Biologie 2025 au Muséum de Toulouse Sur la base du volontariat, des lycéen·nes proposent un projet scientifique en groupe, touchant à un domaine de la biologie et en lien avec la thématique de l’année : Le Vivant en Mouvement 🏃♂️ Un grand bravo aux élèves du lycée Marie-Louise Dissard Françoise de Tournefeuille qui remportent la finale régionale de l'Académie de Toulouse Le laboratoire TBI est très heureux de participer à cet évènement convivial et bienveillant où les élèves montrent rigueur et créativité 🤩 Académie de Toulouse éduscol - Ministère de l'Éducation nationale (MENESR) éduscol - Ministère de l'Éducation nationale (MENESR) INRAE Occitanie-Toulouse Ecole d'Ingénieurs de PURPAN merci aux organisatrices Lucie Ohayon et Anne Peries

Plus que quelques jours pour postuler !